Construite au début du XIVe siècle, elle est datée exactement entre les années 1314-1315 grâce à l'inscription fondatrice retrouvée en 1884 sur le mur est de la salle de prière, ou mur principal, face à Jérusalem, « Sanctuaire en miniature et demeure de le témoignage complété par Isaac Mohed, fils de M. Efraim Waddawa. (construit) dans la soixante-quinzième année. Prends garde, ô Dieu, et hâte-toi de reconstruire Jérusalem. Son noyau essentiel est une salle de prière avec un plan carré de pas plus de 40 m2, accessible par une petite cour et un vestibule.

La salle de prière est couverte de riches gypseries à décors sculptés, dentelles d'étoiles à quatre, six et huit branches, thèmes végétaux et épigraphie hébraïque, principalement tirés du Livre des Psaumes. Ces motifs étaient autrefois polychromes en bleu, rouge et noir et les épigraphiques avec les lettres peintes en rouge sur fond bleu. Dans ses murs principaux, l'est, conserve l'espace voûté, hejal ou tabernacle, où étaient placés les rouleaux de la Torah, c'est-à-dire les cinq premiers livres de l'Ancien Testament et l'ouest, l'espace encadré par un arc pointu polylobé où avec selon toute vraisemblance la bimahou chaire sur laquelle les écritures sacrées étaient lues. Sur le mur sud, dans sa partie supérieure, il y a une galerie avec trois petits balcons, dite galerie des femmes, un espace conçu pour qu'elles puissent assister aux offices, séparées des hommes.