L'église de Panagia Ekatontapiliani est située à quelques mètres du port de Parikia, la capitale de Paros. C'est l'un des monuments paléochrétiens les mieux conservés de Grèce. Selon la légende, l'église d'origine a été construite par Saint Constantin, premier empereur de Constantinople, après l'offrande de sa mère, Sainte-Hélène.
Au cours de son voyage en Terre Sainte à la recherche de la Sainte Croix, une tempête a amené Sainte-Hélène à Paros, où elle a promis à la Vierge de construire une église si sa quête réussissait. Cette église a été construite par son fils Constantin après sa mort et elle était dédiée à l'Assomption de la Vierge.
L'église d'origine a été construite au 4ème siècle après JC et était une basilique à trois nefs. Au 6ème siècle après JC, l'empereur byzantin Justinien a fait des réformes à l'église et a ajouté un dôme. Plus de réformes ont été effectuées au cours des siècles et aujourd'hui l'église est un complexe d'éléments paléochrétiens, byzantins et post-byzantins. Considérant que les premiers chrétiens avaient l'habitude de construire leurs églises avec des parties des anciens temples, cette église a également des parties en marbre des antiquités situées à Paros.
Le nom Ekatontapiliani signifie l'Église aux cent portes . Selon la tradition, l'église a 99 portes et une porte secrète s'ouvrira lorsque l'église de Sainte-Sophie à Constantinople sera de nouveau orthodoxe. L'ensemble du complexe d'Ekatontapiliani comprend l'église principale de la Vierge Marie avec les chapelles internes d'Agios Anargiros, Agios Philippos et Osia Theoktisti (qui a aimé et est mort dans ce monastère au 9ème siècle après JC). À l'extérieur de l'église principale, il y a les chapelles d'Agios Nikolaos, d'Agia Theodosia et d'Agios Dimitrios. Dans la cour du monastère, il y a aussi un baptistère et les cellules des moines.
Le monastère de Panagia Ekatontapiliani célèbre le 15 août lors d'une grande fête religieuse. Il est considéré comme le protecteur de Paros et son icône est censée faire des miracles.