Le nom Macrae est dérivé du gaélique "MacRaith", qui signifie "Fils de la Grâce".

On pense que le clan Macrae est originaire d'Irlande et partage une ascendance commune avec le clan Mackenzie et le clan Maclean.

Alliés historiques des MacKenzies, lorsque les MacDonalds de Sleat ont assiégé le château d'Eilean Donan dans le cadre de leur tentative de restauration de la seigneurie des îles, c'est un membre du clan MacLean qui a abattu le chef MacDonald avec une flèche.

La devise du clan Macrae est "Fortitudine" et la crête du clan est un bras tenant une épée en l'air.